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DNA合成儀進(jìn)行合成的一些問(wèn)題解說(shuō)

   下面對(duì)DNA合成儀進(jìn)行合成的一些問(wèn)題進(jìn)行解說(shuō)解說(shuō)。
 ?。薄NA合成粗產(chǎn)物中含有什么雜質(zhì)?  
  DNA合成儀合成的粗產(chǎn)物經(jīng)過(guò)濃氨水氨解以后,其中除了含有所需的目的DNA片段(n)以外,還含有合成反應(yīng)過(guò)程中產(chǎn)生的目的片段短的失敗片段(n-1,n-2,…)以及脫保護(hù)基團(tuán)產(chǎn)生的銨鹽。需要通過(guò)純化去除短片段、通過(guò)脫鹽去除鹽分。 
 ?。病⑷绾螜z測(cè)引物的純度?  
  實(shí)驗(yàn)室方便的作法是用PAGE方法。使用加有7M尿素的16%的聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行電泳。取0.2-0.5OD的引物,用尿素飽和液溶解或引物溶液中加入尿素干粉直到飽和,上樣前加熱變性(95oC,2mins)。加入尿素的目的一是變性,二是增加樣品比重,容易加樣。600V電壓進(jìn)行電泳,一定時(shí)間后(約2-3小時(shí)),剝膠,用熒光TLC板在紫外燈下檢測(cè)帶型,在主帶之下沒(méi)有雜帶,說(shuō)明純度是好的。(有時(shí)由于變性不充分,主帶之上可能會(huì)有條帶,乃是引物二級(jí)結(jié)構(gòu)條帶。) 



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